Был призван в ряды Красной Армии в 1936 году. В годы Великой Отечественной войны Сергей Прудников – старший лейтенант интендантской службы 73-го отдельного батальона связи 9-го стрелкового корпуса.

Награждён орденом Отечественной войны II степени.

 После войны трудился на НЭВЗе.