До войны работал на Новочеркасском паровозостроительном заводе. Когда началась Великая Отечественная ушёл на фронт. Рядовой С.С.Войнов пропал без вести.

Имя Стефана Семёновича Войнова увековечено на стеле, посвящённой погибшим воинам-паровозстроителям, в заводском парке.